秦漢時期，是風水理論的形成時期。在這個時期，由於大規模宮室的修建，為風水術的發展提供了物質條件，而董仲舒等人的著作則為風水提供了思想理論。以陰陽、五行為基礎的世界觀逐漸形成，風水理論日益走向成熟。

與此同時，風水術也日益變得玄奧神秘。先秦相地術中的迷信成分進一步發展，特別在東漢時期，加入了天文學和其他讖緯內容。在各種建築中，禁忌和迷信十分盛行。原本樸素的相地術分成了兩個方向，其中以“圖宅”為代表的風水流派，因為傾向於發展迷信而走上歧路。

此外，五行學說也興起於秦漢時期，著名代表人物是鄒衍。五行學說認為，自然萬物有水、木、金、火、土等五種基本屬性。鄒衍說“五德從所不勝，虞土、夏木、殷金、周火”。他還認為，五行以相剋的關系傳遞，即木克土、金克木、火克金、水克火、土克水。

到了西漢末年，劉歆繼承和發展了五行學說，提出“五行相生”的說法，即木生火，火生土，土生金，金生水，水生木……以此循環。劉歆有力地補充了五德終始說的相剋理論，使五行之說成為一個成熟完善的理論體系。五者之間形成周而復始的相生相剋的關系，構成了一種動態的平衡。
此外，五行與陰陽觀的結合，又形成了陰陽五行學說：有了陰陽五行的平衡和協調，才能推動和維持所有事物的正常生長、發展、變化和消亡。陰陽五行學說被看成是中國古代自然科學和社會科學的總原則，對後世產生了深遠的影響。

陰陽五行學說極大地促進秦漢時期術數的迅速發展。到漢武帝時期，術數名家眾多，如五行家、堪輿家、建除家、叢辰家、歷家、天人家、太乙家等，他們共同推動了風水學的發展。